Tilstanden for sjøørret i 1279 vassdrag har blitt vurdert. Av disse var det 1080 vassdrag som trolig naturlig hadde egne bestander av sjøørret, 170 vassdrag med forekomster av sjøørret og 29 vassdrag der det neppe forekommer sjøørret regulært. På grunn av ulike inngrep har 29 vassdrag tapt alt produksjonsareal, og i 35 vassdrag har produksjonen blitt så liten at vassdragene neppe har en egen sjøørretbestand i dag. Blant alle 1251 vassdrag med sjøørret var det mindre enn en fjerdedel av vassdragene der sjøørreten ble klassifisert til å ha god eller svært god tilstand. Nesten 40 % ble klassifisert til å være i dårlig eller svært dårlig tilstand, eller som tapt. Den største negative påvirkningen på sjøørreten var lakselus, som påvirket sjøørret i svært mange av vassdragene over det meste av landet. Nesten halvparten (47 %) av den samlede negative påvirkning på sjøørreten i alle klassifiserte vassdrag kom fra lakselus. Landbruksaktivitet hadde også en negativ effekt på sjøørret i mange vassdrag (35 % av vassdragene), men samlet negativ effekt (15 %) var markant lavere enn for lakselus. Deretter kom vannkraft, samferdsel og arealinngrep som viktige påvirkninger.